La Casa de la Libertad, aparte de replantear la historia boliviana, creará salas adicionales en el Museo Nacional de Historia que recogerán “las fogosas exuberancias del trópico con la diáfana claridad de los Andes y las románticas dulzuras del valle. Los tormentosos encuentros y apasionados amores, incontenibles e irreversibles, entre el maravilloso imperio incaico — la laboriosa cultura aymara”, de acuerdo con el director Mario Linares. “También estarán incluidos los creativos pueblos amazónicos y la rica diversidad de nuestras naciones precolombinas, con la no menos fértil sangre española, en este sagrado -silencioso-sugerente-inspirador templo que dio a luz una bella hija morena que se llamó Bolivia”.
Las nuevas salas contendrán los siguientes hechos históricos:
- Cultura y organización política prehispánica: aldeas, señoríos, capitanías, etc.
- La presencia Inca en Charcas (Bolivia): características políticas del Tawantinsuyo.
- El Estado Colonial y el sistema de las dos repúblicas: La Real Audiencia de Charcas y los cacicazgos de la república de indios.
- La Universidad de San Francisco Xavier de Chuquisaca (la Escolástica y la Ilustración como precursoras de la Independencia de América y Bolivia).
- La sublevación general de indios (1780-1783).
- El movimiento revolucionario del 25 de Mayo de 1809 y los movimientos juntistas en Charcas.
- Guerra de la Independencia y la lucha de los guerrilleros.
- Sala de la Independencia.
- La formación territorial de Bolivia.
- La Batalla de Ingavi
- Invasión del Pacífico
- La Guerra del Acre
- La Guerra del Chaco
- Los presidentes de Bolivia y su contexto histórico.
- Los movimientos indígenas republicanos en las tierras altas y bajas.
- Las regiones de Bolivia y las relaciones entre las mismas.
- La historia contemporánea de Bolivia y la formación de un Estado Plurinacional.

